In silico study of flavonoid compounds from dadap serep (Erythrina subumbrans) twigs and roots as antipyretics / Studi in silico senyawa golongan flavonoid dari ranting dan akar dadap serep (Erythrina subumbrans) sebagai antipiretik

Studies in silico offer an exciting world where researchers use the power of computing to explore a variety of scientific phenomena. In silico allows researchers to virtually test thousands of potential compounds, including natural ingredients, interacting with biological targets. This can speed up drug discovery and reduce reliance on expensive laboratory trials. Erythrina subumbrans is a plant in the Papilonaceae family that has been phytochemically tested to contain flavonoids suspected of having antipyretic effects. The study aims to identify the most potentially antipyretic compounds among the eight flavonoid groups of the branches and roots of Dadap Serep (Erythrina subumbrans). The study uses the molecular docking method. Tests were conducted against eight flavonoids of the branches and roots of the Dadap serep, namely pinocembrin, 3,6,4’-trichydroxyflavone, 3,6-dihydroxylflavon, lupalbigenin, erysubin F, genistein, 5-hydroxyphoronone, and abyssinone V, as well as positive controls of paracetamol against target proteins with PDB code 1CX2. The data analysis compared the total binding energy and hydrogen binding scores on the emerging amino acid residues. The test results showed that the three most potentially antipyretic compounds were lupalbigenin, erysubin F, and abyssinone V, with consecutive total bending energy scores of -126.3 kcal/mol, -113.1 kcal/mol, and -111.8 kcal/mol.

Studi in silico menawarkan dunia yang menarik di mana peneliti menggunakan kekuatan komputasi untuk menjelajahi berbagai fenomena ilmiah. In silico memungkinkan peneliti untuk secara virtual menguji ribuan senyawa potensial termasuk bahan alam dalam interaksi dengan target biologis. Hal ini dapat mempercepat waktu proses penemuan obat dan mengurangi ketergantungan pada uji coba laboratorium yang mahal. Dadap serep (Erythrina subumbrans) adalah tanaman golongan keluarga Papilonaceae yang secara uji fitokimia dilaporkan memiliki kandungan flavonoid yang diduga memiliki efek antipiretik. Tujuan penelitian ini adalah untuk menentukan senyawa yang paling berpotensi sebagai antipiretik diantara delapan senyawa golongan flavonoid dari ranting dan akar Dadap Serep (Erythrina subumbrans). Penelitian ini menggunakan metode molecular docking. Pengujian dilakukan terhadap delapan senyawa golongan flavonoid dari ranting dan akar Dadap Serep (Erythrina subumbrans) yaitu pinocembrin; 3,6,4’-trihydroxyflavone; 3,6- dihydroxyflavone; lupalbigenin; erysubin F; genistein; 5-hydroxysophoranone dan abyssinone V, serta kontrol positif paracetamol terhadap protein target dengan kode PDB: 1CX2. Analisis data dilakukan dengan cara membandingkan skor total energi ikatan dan ikatan hidrogen pada residu asam amino yang muncul. Hasil uji menunjukkan bahwa tiga senyawa yang paling berpotensi sebagai antipiretik adalah lupalbigenin, erysubin F, dan abyssinone V dengan skor total energi ikatan berturut-turut -126,3 kkal/mol; -113,1 kkal/mol dan -111,8 kkal/mol.