Isolation and identification with 16s rRNA gene of endophytic bacteria from papaya (Carica papaya L.) and test of its antibacterial activity / Isolasi dan identifikasi dengan gen 16s rRNA bakteri endofit dari tanaman pepaya (Carica papaya L.) serta uji aktivitas antibakterinya

Endophytic bacteria live symbiotically in host plant tissues and can produce the same bioactive compounds as their host plants, including antibacterial agents. This study aimed to isolate and test the antibacterial activity of endophytic bacteria from the Carica papaya plant and to carry out molecular identification using the 16S rRNA gene against bacterial isolates with the most excellent antibacterial activity. A total of six isolates of endophytic bacteria were successfully separated through the purification process. Through microscopic identification using gram staining, all endophytic bacterial isolates belong to gram-positive bacteria. The results of the antibacterial activity test showed that the six isolates of papaya plant endophytic bacteria could cause the growth of Escherichia coli bacteria but not against Staphylococcus aureus bacteria. The average diameter of the inhibition zone against Escherichia coli bacteria is as follows: RB1: 9.35 mm; RB2: 9.4mm; RB3: 9.15mm; CB1: 9.1mm; CB2: 9.2mm; CB3: 8.8mm; FB1: 8.45mm; FB2: 8.75mm; and FB3: 8.6mm. All papaya plant endophytic bacterial isolates had an inhibition zone categorized as weak. Bacterial isolate RB2, which has the most excellent antibacterial activity, is identified molecularly as Bacillus cereus.

Bakteri endofit adalah jenis bakteri yang hidup secara simbiosis di dalam jaringan tanaman inang dan memiliki kemampuan untuk menghasilkan senyawa bioaktif yang sama dengan tanaman inangnya, termasuk sebagai agen antibakteri. Tujuan dari penelitian ini adalah untuk mengisolasi dan menguji aktivitas antibakteri dari bakteri endofit yang berasal dari tanaman Carica papaya, serta melakukan identifikasi molekuler menggunakan gen 16S rRNA terhadap isolat bakteri dengan aktivitas antibakteri terbesar. Sebanyak enam isolat bakteri endofit berhasil dipisahkan melalui proses penyucian. Melalui identifikasi mikroskopis menggunakan pewarnaan gram, semua isolat bakteri endofit tersebut tergolong dalam bakteri gram positif. Hasil pengujian aktivitas antibakteri menunjukkan bahwa keenam isolat bakteri endofit tanaman papaya memiliki kemampuan untuk menghambat pertumbuhan bakteri Escherichia coli, namun tidak terhadap bakteri Staphylococcus aureus. Diameter rata-rata zona hambat terhadap bakteri Escherichia coli adalah sebagai berikut: RB1: 9,35 mm; RB2: 9,4 mm; RB3: 9,15 mm; CB1: 9,1 mm; CB2: 9,2 mm; CB3: 8,8 mm; FB1: 8,45 mm; FB2: 8,75 mm; dan FB3: 8,6 mm. Semua isolat bakteri endofit tanaman papaya memiliki zona hambat yang dikategorikan sebagai lemah. Isolat bakteri RB2, yang memiliki aktivitas antibakteri terbesar, teridentifikasi secara molekuler sebagai Bacillus cereus.