Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui pengaruh pupuk MKP dan ekoenzim, serta untuk mengetahui pengaruh interaksi terhadap pemberian pupuk MKP dan ekoenzim dalam meningkatkan kualitas pertumbuhan, produksi, serta uji kandungan metabolit sekunder. Penelitian ini dilaksanakan pada bulan Desember 2024 sampai dengan Maret 2025 di Desa Klumpang, Kec. Hamparan Perak, Sumatera Utara. Menggunakan rancangan acak kelompok (RAK) faktorial dengan
menggunakan 2 faktor perlakuan, yang masing-masing perlakuan di ulang sebanyak 3 kali. Parameter yang diamati tinggi tanaman (cm), jumlah daun (helai), bobot segar tanaman (gr), bobot umbi basah (gr), bobot umbi kering (gr) dan uji metabolit sekunder pada 6 senyawa yaitu alkaloid, flavonoid, terpenoid, saponin, dan tanin. Hasil penelitian menunjukkan bahwa pupuk MKP memberikan pengaruh
nyata terhadap tinggi tanaman umur 4 MST, 6 MST, 8 MST, parameter bobot tanaman, bobot umbi basah, dan bobot umbi kering. Perlakuan terbaik terdapat pada M1 (dosis MKP 10 gr/tanaman). Perlakuan ekoenzim tidak memberikan pengaruh nyata pada semua parameter. Interaksi pemberian pupuk MKP dan ekoenzim tidak berpengaruh nyata pada semua parameter. Kombinasi perlakuan terbaik terdapat pada perlakuan M2E0 (MKP 20 gram/tanaman dan ekoenzim (kontrol)). Serta uji fitokimia metabolit sekunder pada ekstrak bawang merah (Allium cepa L) terus meningkat seiring dengan peningkatan dosis pupuk MKP dan ekoenzim. Perlakuan terbaik terdapat pada perlakuan M2E2 (MKP 20 gram/tanaman dan ekoenzim 20 ml/liter air) dengan hasil 4 sampai 5 plus yang ditunjukkan pada hasil lab.